武漢工程大學總共有86個專業(yè)。

武漢工程大學本科專業(yè)有81個：藥物制劑、藥物制劑、礦物加工工程、采礦工程、食品科學與工程、礦物加工工程、通信工程、生物工程、石油工程、法學、無機非金屬材料工程、資源勘查工程、國際經(jīng)濟與貿(mào)易、理論與應用力學、行政管理、智能科學與技術、計算機科學與技術、信息與計算科學、軟件工程、網(wǎng)絡工程、高分子材料與工程、工業(yè)設計、應用化學、機械設計制造及其自動化、材料科學與工程、城市規(guī)劃、生物技術、材料成型及控制工程、建筑學、土木工程、過程裝備與控制工程、飛行器設計與工程、環(huán)境工程、信息管理與信息系統(tǒng)、測控技術與儀器、印刷工程、安全工程、熱能與動力工程、光信息科學與技術、環(huán)境監(jiān)察、自動化、交通運輸、工程管理、材料物理、化學工程與工藝、材料化學、電子信息工程、制藥工程、數(shù)學與應用數(shù)學、工商管理、英語、市場營銷、會計學、電子商務、公共事業(yè)管理、廣告學、法學類、護理學類（中外臺作辦學）、對外漢語、測繪類、海洋工程類（中外合作辦學）、工商管理類、護理學類（中外合作辦學）、計算機類、機械工程、化工與制藥類、地理信息科學、礦業(yè)類、材料類、環(huán)境科學與工程類、機械類、生物科學類、儀器儀表類、藥學類(中外合作辦學)、電氣類、海洋工程類、漢語國際教育、經(jīng)濟與貿(mào)易類、土木類、海洋科學類、土建類。

武漢工程大學其他專業(yè)有5個：化工與制藥、道路橋梁與渡河工程、經(jīng)濟學、材料、電氣工程及其自動化。